| 1995年01月 | 第2回 | 日本ホラー小説大賞 |
「パラサイト・イヴ」 | 大賞 |
| 1995年12月 | 第8回 | このミステリーがすごい! |
『パラサイト・イヴ』 | 第10位 |
| 1996年08月 | 第27回 | 星雲賞 |
『パラサイト・イヴ』 | 参考候補 |
| 1998年03月 | 第19回 | 吉川英治文学新人賞 |
『BRAIN VALLEY』 | 候補 |
| 1998年05月 | 第11回 | 山本周五郎賞 |
『BRAIN VALLEY』 | 候補 |
| 1998年08月 | 第29回 | 星雲賞 |
『BRAIN VALLEY』 | 参考候補 |
| 1998年11月 | 第19回 | 日本SF大賞 |
『BRAIN VALLEY』 | 受賞 |
| 1998年12月 | 第11回 | このミステリーがすごい! |
『BRAIN VALLEY』 | 第33位 |
| 2000年08月 | 第31回 | 星雲賞 |
『小説と科学――文理を超えて創造する』 | 参考候補 |
| 2001年08月 | 第32回 | 星雲賞 |
『八月の博物館』 | 参考候補 |
| 2002年07月 | 第33回 | 星雲賞 |
『虹の天象儀』 | 参考候補 |
| 2003年07月 | 第34回 | 星雲賞 |
『あしたのロボット』 | 参考候補 |
| 2005年07月 | 第36回 | 星雲賞 |
『ロボット・オペラ』 | 参考候補 |
| 2005年12月 | 第18回 | このミステリーがすごい! |
『デカルトの密室』 | 第22位 |
| 2005年12月 | 第26回 | 日本SF大賞 |
『デカルトの密室』 | 候補 |
| 2006年04月 | 第3回 | 本屋大賞 |
『デカルトの密室』 | 第79位 |
| 2006年07月 | 第37回 | 星雲賞 |
『デカルトの密室』 | 参考候補 |
| 2009年07月 | 第40回 | 星雲賞 |
『サイエンス・イマジネーション――科学とSFの最前線、そして未来へ』 | 参考候補 |
| 2011年12月 | 第32回 | 日本SF大賞 |
『希望』 | 候補 |
| 2012年 | 第24回 | SFマガジン読者賞 |
「きみに読む物語」 | 第2位 |
| 2014年07月 | 第45回 | 星雲賞 |
「ミシェル」 | 参考候補 |
| 2017年04月 | 第14回 | 本屋大賞 |
『この青い空で君をつつもう』 | 第205位 |
| 2021年08月 | 第52回 | 星雲賞 |
『100分de名著「アーサー・C・クラーク」スペシャル2020年3月ただの「空想」ではない』 | 受賞 |
